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从富含多酚的多糖植物中提取高质量核DNA的方法已得到国家发明专利的批准。

发布于:2019-08-31  |   作者:365bet真正网站
2月6日,中国科学院武汉植物园研究员韩月鹏,王璐,顾某共同研究了“从富含多酚的多酚植物中提取高质量核酸DNA的方法”。赵先生获得了国家发明专利。
(专利号ZL201110456519。
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高通量测序技术的快速发展和测序成本的显着降低使基因组测序和重测序成为植物基因组研究的一个组成部分。
获得高质量的核DNA(脱氧核糖核酸)是高通量测序的基础。
目前,用于高通量测序或构建基因组文库的核DNA通常通过SDS(十二烷基苯磺酸钠),CTAB(十六烷基三甲基溴化铵)或基于二氧化硅的吸附进行。通过旋转柱等提取
上述方法广泛用于从植物中提取DNA。
然而,在植物,特别是水生植物和木本植物的生长期间,DNA提取受到严重影响,因为产生了大量的次级代谢物,例如多糖和多酚。
通过常规DNA提取方法不能获得高纯度和优异质量的核DNA。
此外,植物多糖和多酚的组成和含量将根据植物的生长周期和环境条件和物种而变化。目前,没有适用于大多数植物物种或组织材料的核DNA提取方法。
高通量测序技术对DNA完整性和外核DNA(如线粒体DNA和叶绿体DNA)的污染非常敏感,因为多酚和其他物质会氧化基因组DNA双链体并导致改变。是的。多糖和DNA的持续时间减少,物理和化学性质相似,由于核外DNA的存在,很容易引起核酸的共沉淀,从而降低速度。测序覆盖率降低,研究成本迅速增加,并导致严重干扰。
已经发现,无论测序或从头(初始)重测序,多酚和核外DNA的氧化的存在都会显着干扰基因组序列的构建。
尽管一些现有的基因组提取方法需要使植物材料变黄以去除诸如叶绿体DNA的核外遗传物质,但黄化的不利影响会使材料的生长状态恶化,通常是代谢物的诱导。随着多酚的增加,它们变成次要的,从而恶化了多酚的氧化程度。
此外,即使在变黄之后,也难以去除高等植物细胞中的线粒体DNA污染。
对于多年生高大的木本植物和大多数水生植物,很难获得大量黄色幼叶,从而开发出可在自然生长条件下使用植物叶子的组织用高纯度和高质量的材料提取高质量核DNA的方法已成为果树和水生植物等经济作物基因组学研究的迫切需要。
本发明克服了上述问题,克服了现有植物的现有基因组核酸提取方法的缺点和缺点,并从富含多糖的多酚植物中提取了高质量的核DNA,并且描述治疗过程。以前它可以有效地去除线粒体,叶绿体和其他细胞器。干扰核酸提取过程的次级代谢产物,适用于多种植物物种,如植物材料中存在的多糖和多酚,或具有相对完整细胞结构的冷冻保存组织,特别适合进一步研究高性能测序|文献信息| J-GLOBAL


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